Uzmanlık eğitiminin ardından 1993–1995 yılları arasında Amerika Birleşik Devletleri’nde, Medical College of Wisconsin (Milwaukee, WI)’da Research Fellow olarak çalışmış; bu süreçte cerrahi alanında akademik ve klinik deneyimini uluslararası düzeyde geliştirmiştir. Türkiye’ye dönüşünün ardından Afşin ve Kahramanmaraş Devlet Hastaneleri’nde uzman doktor olarak görev yapmıştır. 1997 yılında Sağlık Bakanlığı bursu ile Elmhurst Hospital/New York’ta Yoğun Bakım, Acil ve Ambulans Hizmetleri alanlarında gözlemci doktor olarak bulunmuştur.
1998 yılında Kahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi Tıp Fakültesi’nde yardımcı doçent olarak akademik kariyerine başlamış, kurucu ekip içerisinde yer almıştır. 2002 yılında Doçent, 2008 yılında Profesör unvanını almıştır. Bu süreçte hem Genel Cerrahi uzmanlık öğrencilerinin hem de tıp fakültesi öğrencilerinin eğitiminde aktif rol üstlenmiştir. Üniversite bünyesinde Kurucu Başhekimlik (iki dönem, toplam 6 yıl), Dekan Yardımcılığı, Sağlık Yüksekokulu ve Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu Yönetim Kurulu Üyeliği, Tıp Fakültesi Yönetim ve Fakülte Kurulu Üyeliği ile Cerrahi Tıp Bilimleri Bölüm Başkanlığı gibi birçok idari görevde bulunmuştur.
Akademik gelişimini uluslararası merkezlerde de sürdürmüş; 2010 yılında Floransa Üniversitesi Meme Kanseri Merkezi’nde, 2011 yılında Royal Free Hospital Breast Unit (Londra)’da ve 2012 yılında UCL Hospital Colorectal Unit (Londra)’da gözlemci doktor olarak çalışmıştır.
Şubat 2013 itibarıyla Sağlık Bakanlığı Ümraniye Eğitim ve Araştırma Hastanesi’nde eğitim görevlisi olarak görev yapmaya başlamış; 2016 yılından itibaren Sağlık Bilimleri Üniversitesi Ümraniye Eğitim ve Araştırma Hastanesi Genel Cerrahi Eğitim Sorumlusu olarak görevini sürdürmektedir. 2017 yılında Sağlık Bilimleri Üniversitesi Genel Cerrahi Anabilim Dalı Başkanlığı görevine atanmış olup halen İstanbul Sağlık Bilimleri Üniversitesi Tıp Fakültesi Ümraniye SUAM’da Profesör Doktor olarak akademik ve klinik çalışmalarına devam etmektedir.
Prof. Dr. Fikret Ezberci, bugüne kadar 50’nin üzerinde ulusal ve uluslararası bilimsel yayına imza atmış; çalışmalarına 200’ün üzerinde atıf yapılmıştır. Araştırma görevlilerinin tez danışmanlığını yürütmüş, halen tez danışmanlığı ve Moleküler Kanser Tıbbı Doktora Programı kapsamında eğitici olarak görev almaktadır.
Cerrahi ilgi alanları arasında meme kanseri ve cerrahisi, tiroid ve adrenal bez hastalıkları, mide kanseri cerrahisi, kolon kanseri ve cerrahisi, safra kesesi hastalıkları ile açık ve kapalı tekniklerle karın duvarı ve kasık fıtığı cerrahisi yer almaktadır.
İyi düzeyde İngilizce bilen Prof. Dr. Fikret Ezberci evli ve iki çocuk babasıdır. Akademik birikimi, idari deneyimi ve uzun yıllara dayanan cerrahi tecrübesi ile genel cerrahi alanında hizmet vermeye devam etmektedir.